作为顾命大臣的匡源和肃顺一起，向慈禧太后叫板，一度让慈禧非常被动。但后来的事请，我们学历史时都知道了，慈禧太后联合慈安太后与奕訢合谋，发动了“辛酉政变”，罢免了“顾命八大臣”，并杀掉了肃顺等人。一向比较温和的匡源侥幸逃过了一劫，只是被罢了官。匡源被罢官后，转而投身教育，弟子三千，桃李遍天下。
慈禧太后为什么没杀匡源呢？其中有一个传闻：
当时慈禧在安擦罪名时，最重要的一点就是“力主北狩，致先帝归天”，意思是说，当时是八大臣让咸丰皇帝离开北京，致使其到承德后染病身亡。但事实上，匡源当时是反对“北狩”的。到了危急关头，匡源只好为自己辩护，他说：“当时先帝已经起身离开座位了，臣仍然跪在那里劝他不要北狩，臣实在冤枉啊。”这时，慈禧太后身旁的大太监说了一句公道话，他说：“是这样，大臣们都已走散，只有匡大人伏榻苦谏。”慈禧太后一看，这条罪名安不到匡源头上，转念一想，自己的主要对手已经除掉了，一个匡源不足为患，于是就只把他罢了官，连充军发配新疆也免了。这位帮匡源说话的大太监是谁呢？一种说法是李莲英，但宋普先生认为，这个太监应该是一位姓刘的公公，具体名字已不可考。
在高阳先生的《慈禧前传》中，对于匡源逃过一劫的原因则是另外一种说法。当时定罪时，匡源、景寿等五大臣罪过差不多重，有人也想过严惩匡源以讨好慈禧。但是，景寿还有一重身份，他是奕訢的亲姐夫，如果严办匡源，可能会殃及景寿。当时谁敢得罪奕訢啊？在这种请况下，匡源跟着沾了光，只落了个革职的处分。
