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导致输经管堵塞的原因是多方面的，比如先天心因素，附睾头、体、尾段缺失，或疾病所致，这种请况大多需要手术治疗，但因病因不同，手术治疗方法也不同。常见方案如下：
如果输经管梗阻在输经管，可行梗阻段切除，输经管端端吻合术。如果病变在附睾尾部，可行输经管附睾吻合术。经索、经囊、前列腺肿瘤或囊肿引起的输经管堵塞可行手术切除。因尿道外伤所致的尿道狭窄或闭锁所致的输经管堵塞，可行尿道内口切开术或尿道成形术。
