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1、容易造成身体损伤
高热惊厥发生时，患儿会有抽搐、牙关紧闭的症状，有可能会造成患儿口舌部的擦伤。如果发病时，患儿处于台阶等高处时，突然的抽搐、意识丧失、目光呆滞等，可能会导致患儿从高处摔落，造成跌伤擦伤。此外，由于高热惊厥的症状发生突然，反应强烈，可能会使患儿产生恐惧感。
2、有一定的复发机率。
约有30%的小儿高热惊厥患者在初次发作后的2年半内容易复发。易复发患儿一般具有以下一个或多个特点：一是年龄为6月至3岁，二是初期高热时突然惊厥，三是症状呈现全身心，四是惊厥时间短，五是神智清醒快。
3、可能会出现后遗症。
如果小儿高热惊厥发作频繁或惊厥持续时间较长，均可对患儿的脑部造成一定的损害。约20%的小儿高热惊厥患者会在初次惊厥后10年左右发展成癫痫。此外也有患儿产生不同程度的智力损伤、轻度脑功能障碍等。
